BMB530: Grundlæggende biokemi
Det Naturvidenskabelige Studienævn
Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser
EKA: N200009112, N200009102, N200009122
Censur: Intern prøve, en bedømmer, Ekstern prøve
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Efterår
Niveau: Bachelor
STADS ID (UVA): N200009101
ECTS-point: 5
Godkendelsesdato: 21-02-2022
Varighed: 1 semester
Version: Godkendt - aktiv
Indgangskrav
Kurset kan ikke tages af studerende der har taget BMB532, eller har BMB532 som et obligatorisk fag på deres studieordning.
Faglige forudsætninger
Studerende, der følger kurset, forventes at:
- Have kendskab til biologi, kemi og databehandling
- Kunne anvende Word og Excel
- Kunne forberede eksperimentelle øvelser efter anvisning i protokol
Formål
Kurset har til formål at sætte den studerende i stand til at forstå enzymers basale katalytiske egenskaber og virkemåde, membraners opbygning og funktion samt et basalt kendskab til eukaryote cellers biokemi på molekylært niveau. De studerende indføres i den grundlæggende teori om enzymer og membraner, samt de metoder, der anvendes i arbejdet med disse. Endvidere gennemgås udvalgte biokemiske processer i dyre- og planteceller med fokus på metabolske omsætningsveje i pattedyrceller og deres regulering.
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurset FA508 og giver et fagligt grundlag for at tilegne sig viden om cellers biokemi i forhold til fagområder indenfor farmakologi, kemi og biologi.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på:
- at anvende metoder inden for enzymkinetik og biokemi i teori og praktisk
- vidensdannelse og eksperimentelle metoder inden for det farmaceutiske/biologiske område og tilstødende fagområder
- selvstændigt at anvende en række laboratorieteknikker indenfor det biokemiske fagområde
Målbeskrivelse
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
- anvende metoder inden for enzymkinetik og kemisk kinetik til teoretisk og praktisk bestemmelse af karakteristiske konstanter, som f.eks. enzymers KM og turnover number
- forklare, hvorledes enzymers aktiviteter reguleres, herunder allosteri
- forklare biologiske membraners opbygning, samt hvorledes stoffer transporteres igennem disse
- beskrive nogle reaktionsmekanismerne for simple enzymkatalyserede reaktioner
- beskrive det termodynamiske og kinetiske grundlag for metabolismen samt forklare den frie energi og ligevægtskonstantens betydning for koblede reaktioner i metabolismen og ATP´s universelle rolle heri
- beskrive transport af glukose i blodet og hvorledes den cellulære optagelse finder sted
- beskrive metabolitter, enzymer og coenzymer fra glykolysen, glukoneogenesen, citronsyrecyklus, principperne for regulering og integrering af reaktionsvejene
- beskrive fotosyntesens basale lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanisme i planter (biologer)
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
- Kemisk kinetik og termodynamik
- Simpel Michaelis-Menten kinetik
- Kooperativitet og allosteri
- Regulering af enzymaktivitet
- Eksempler på enzymreaktionsmekanismer
- Biologiske membraners bestanddele
- Lipidstrukturer i vandig opløsning
- Modeller af biologiske membraner
- Diffusion af stoffer gennem membraner
- Aktiv og passiv membrantransport
- Ionkanaler
- Metabolisme: basale begreber og principper
- Glykolyse og gluconeogenese
- TCA og Oxidativ fosforylering
- Glykogen metabolisme
- Fotosyntesens lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanismer
- Eksperimentelle teknikker i biokemi
De studerende vil få lejlighed til at undersøge simple biokemiske problemstillinger gennem 2 laboratorieøvelser á 3 timer hver:
- øvelse: enzymkinetik
- øvelse: stoftskifte i gærceller
Litteratur
Laurence A. Moran (Author), Robert A Horton (Author), Gray Scrimgeour (Author), Marc Perry (Author): Principles of Biochemistry, 5th Edition.
Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.
Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.
Eksamensbestemmelser
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Forudsætninger
| Type | Forudsætningsnavn | Forudsætningsfag |
|---|---|---|
| Delprøve | Forudsætningsprøve a) | N200009101, BMB530: Grundlæggende biokemi |
Udprøvninger
Rapporter over laboratorieøvelser
EKA
N200009112
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
Bestået/Ikke bestået
Identifikation
Fulde navn og SDU brugernavn
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
1
Eksamenselement b)
Tidsmæssig placering
Januar
Udprøvninger
Skriftlig eksamen
EKA
N200009102
Censur
Ekstern prøve
Bedømmelse
7-trinsskala
Identifikation
Studiekort
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Varighed
4 timer
Hjælpemidler
Hjælpemidler til eksamen er personlig håndskrevne noter, som enten er skrevet på papir eller på tablet (eller lignende) og derefter printet ud. Bogen, noter som er kopieret og printet eller maskinskrevet er ikke tilladt. Indbygget standardlommeregner i hhv. Windows/MAC er tilladt. Maple, Mathematica, Mathcad, MathLab, GeoGebra Apps, R, R- Studio, CAS TI-Nspire, Ms Excel og LibreOffice Calc er også tilladt. WordMat er tilladt, men anbefales ikke. Brug af WordMat er på eget ansvar og der ydes ikke support ved nedbrud eller andre fejl som er forårsaget af programmet.
Internet er ikke tilladt. Du må dog gå ind på kursets hjemmeside i itslearning for at åbne eksamensopgaven.
ECTS-point
4
Uddybende information
Reeksamen ændres til en mundtlig eksamen, hvis der er 13 eller færre studerende tilmeldte. Den mundtlige reeksamen foregår på følgende måde:
- Ved reeksamens start trækker du et nummer som svarer til det emne i BMB530´s curriculum som du skal eksamineres i. Du får emnet og dets spørgsmål udleveret, hvorefter du vil blive spurgt om du har forstået opgaven.
- Du har derefter 25 min til at forberede dig på opgaven. Du bestemmer selv hvordan du vil præsentere materiale der understøtter din besvarelse.
- Du eksamineres af undervisere og censor i 15 min.
- Efter endt eksamination modtager du din bedømmelse.
Forudsætningsprøve a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Udprøvninger
Deltagelse i laboratorieøvelser
EKA
N200009122
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
Bestået/Ikke bestået
Identifikation
Fulde navn og SDU brugernavn
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
0
Uddybende information
Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
- Introfase: 22 timer
- Træningsfase: 26 timer, heraf: Eksaminatorie: 20 timer og Laboratorieøvelser: 6 timer
Aktiviteter i studiefasen:
- Gruppearbejde og rapportskrivning
- Studiegrupper omhandlende eksaminatorieøvelser (valgfrit)
- Eksamensforberedelse ved fordybelse i målbeskrivelse
- Selvstændig forberedelse til laboratorieøvelser
Ansvarlig underviser
Yderligere undervisere
| Navn | Institut | By | |
|---|---|---|---|
| Jonathan R. Brewer | brewer@memphys.sdu.dk | Institut for Biokemi og Molekylær Biologi |
Skemaoplysninger
Administrationsenhed
Team hos Uddannelsesjura & Registratur
Udbudssteder
Anbefalede studieforløb
Overgangsordninger
Overgangsordninger beskriver, hvordan et kursus erstatter et andet kursus, når der ændres i et studieforløb.
Hvis der er lavet en overgangsordning for et kursus vil den fremgå af oversigten.
Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.
Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.