BMB509: Bioanalytisk instrumentering
Det Naturvidenskabelige Studienævn
Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser
EKA: N200004112, N200004102
Censur: Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Efterår
Niveau: Bachelor
STADS ID (UVA): N200004101
ECTS-point: 5
Godkendelsesdato: 12-04-2023
Varighed: 1 semester
Version: Godkendt - aktiv
Kommentar
NEDLÆGGES - udbydes sidste gang E23
- Eksamensforsøg afholdes januar 2024 (ordinær)
- Eksamensforsøg afholdes marts 2024 (reeksamen). Den studerende servicetilmeldes eksamensforsøget.
- Eksamensforsøg afholdes Januar 2025. Den studerende servicetilmeldes eksamensforsøget.
Indgangskrav
Faglige forudsætninger
Studerende, der følger kurset, forventes at:
- Have kendskab til grundlæggende matematiske og fysiske begreber såsom logaritme og eksponentialfunktioner, lineær algebra, simple første ordens differential ligninger, grundlæggende statistik og fysiske principper af elektricitet og optik, som gennemgået i gymnasiet.
- Have kendskab til basal matematik, fysik, kemi og cellebiologi, som præsenteret på 1. år af bachelor uddannelsen samt indholdet af fagene BMB532 Fundamental biokemi og BMB533 Molekylær biologi og proteinkemi.
- Kunne anvende den matematik og fysik, vedkommende har lært på første år af uddannelsen
Formål
Kurset har til formål at give den studerende en forståelse af udvalgte biokemiske teknikker til at undersøge biomolekylære strukturer og funktioner. Teknikker såsom mikroskopi, kromatografi og massespektrometri vil blive demonstreret.
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurserne angivet under forudsætninger, og giver et fagligt grundlag for at studere emnerne i bachelorprojektet og i kurser for avanceret biofotonik og massespektrometri, der er placeret senere i uddannelsen.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
- Give kompetence til at forstå anvendelsen af en række biokemiske teknikker til separation og karakterisering af biomolekylers struktur og funktion, samt den spatiale fordeling af biomolekyler og molekylære komplekser i celler.
- Give færdigheder i anvendelse af disse teknikker for at løse en biologisk problemstilling.
- Give grundlæggende viden om principperne for mikroskopisk optik og computer-støttet billedbehandling, separation af biomolekyler baseret på fysiske-kemiske egenskaber ved hjælp af kromatografi, mikroskopi, detektion og karakterisering af biomolekyler ved hjælp af mikroskopi og massespektrometri og om visualisering og lokalisering af biomolekyler i celler ved hjælp af mikroskopiteknikker.
Målbeskrivelse
Det er læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
- Kende opbygning og funktion af hovedkomponenterne i kromatografisk udstyr.
- Kende opbygning og funktion af hovedkomponenterne i et massespektrometer.
- Kende principperne bag kromatografisk separation af biomolekyler.
- Kende principperne bag massespektrometrisk analyse af biomolekyler (inkl. LC-MS).
- Anvende kromatografiske principper til at optimere kromatografiske separationer.
- Foretage en fortolkning af massespektre.
- Skitsere eksperimenter til kromatografisk separation og massespektrometrisk analyse (inkl. LC-MS) af biomolekyler.
- Foretage en tolkning af data opnået ved mikroskopi, kromatografi og massespektrometri af biomolekyler.
- Forklare relevante principper bag lysets interaktion med materie, som spredning i rummet, absorption, refleksion, refraktion, diffraktion og emission fra molekyler (dvs. fluorescens).
- Beskrive egenskaber og anvendelse af fluorescerende prober brugt i biokemisk og cellebiologisk forskning.
- Kende opbygning og funktion af lysmikroskoper inklusiv optiske komponenter.
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
- Introduktion til mikroskopisk optik og computer-støttet billedbehandling.
- Detektion og karakterisering af biomolekyler ved hjælp af mikroskopi.
- Visualisering og lokalisering af biomolekyler i celler ved hjælp af mikroskopiteknikker.
- Introduktion til massespektrometri.
- Introduktion til kromatografi.
- Kromatografisk separation af biomolekyler baseret på deres fysiske-kemiske egenskaber.
- Kvalitativ og kvantitativ kromatografisk og massespektrometrisk analyse af biomolekyler.
Litteratur
Eksamensbestemmelser
Forudsætningsprøve a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Udprøvninger
Laboratorieøvelser
EKA
N200004112
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
Bestået/Ikke bestået
Identifikation
Fulde navn og SDU brugernavn
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
0
Uddybende information
Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Januar
Forudsætninger
Type | Forudsætningsnavn | Forudsætningsfag |
---|---|---|
Delprøve | Forudsætningsprøve a) | N200004101, BMB509: Bioanalytisk instrumentering |
Udprøvninger
Mundtlig eksamen
EKA
N200004102
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
7-trinsskala
Identifikation
Studiekort
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Varighed
20 min.
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
5
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
- Introfase: Antal timer: 20
- Træningsfase: Antal timer: 20 timer, heraf 8 timer eksaminatorier, 12 timer laboratorieøvelser
Aktiviteter i studiefasen:
- Læse udleverede lærebog, noter, kompendier, artikler og slides fra forelæsningerne
- Hjemmeopgaver
- Selvstændig forberedelse til laboratorieøvelser
Ansvarlig underviser
Navn | Institut | |
---|---|---|
Thomas J.D. Jørgensen | tjdj@bmb.sdu.dk | Biomedicinsk Massespektrometri og systembiologi |
Yderligere undervisere
Skemaoplysninger
Administrationsenhed
Team hos Uddannelsesjura & Registratur
Udbudssteder
Anbefalede studieforløb
Overgangsordninger
Overgangsordninger beskriver, hvordan et kursus erstatter et andet kursus, når der ændres i et studieforløb.
Hvis der er lavet en overgangsordning for et kursus vil den fremgå af oversigten.
Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.
Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.