BB201: Akvatisk mikrobiel og molekylær økologi

Studerende, der følger kurset, forventes at:

• Have kendskab til generel økologi og mikrobiel økologi 
• Kunne håndtere standard-laboratorieudstyr

Kurset er primært for ph.d.-studerende, men kan også følges af kandidatstuderende.

Kurset har til formål at sætte den studerende i stand til at undervise og forske i biogeokemiske, molekylærbiologiske og mikrobiologiske emner, hvilket er vigtigt i forhold til at udføre og formidle forskning i akvatiske sedimenter.

Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurser omhandlende økologi og mikrobiel økologi, og giver et fagligt og metodisk grundlag for at ph.d.-studerende og specialestuderende kan udføre kvalificeret forskning i emnet.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

• Give kompetence til at udføre biogeokemisk, molekylærbiologisk og mikrobiel forskning i akvatiske sedimenter
  
• Give færdigheder i at udføre kvalificeret laboratoriearbejde med avanceret forskningsudstyr
• Give viden om den nyeste forskning inden for sedimenters biogeokemi og mikrobiologi

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

• Diskutere mikroorganismers systematik og evolution 
• Definere de væsentligste biogeokemiske og molekylærbiologiske begreber
• Perspektivere mikroorganismers funktion i biologiske systemer
• Diskutere mikroorganismers rolle for biogeokemiske kredsløb 
• Diskutere hvordan molekylærbiologiske teknikker og bioinformatik kan anvendes til belysning af mikrobiel tilstedeværelse og aktivitet i akvatiske miljøer
• Anvende gængse metoder ved biogeokemiske og molekylærøkologiske undersøgelser af akvatiske sedimenter
• Vurdere og diskutere gyldigheden og betydningen af resultater fra biogeokemiske og molekylærbiologiske undersøgelser af akvatiske sedimenter

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:

• Diversitet og evolution hos mikroorganismer.
• Interaktioner mellem mikrobielle populationer, udvikling af samfund og tilpasning til miljø.
• Karakterisering af mikrobielle samfund med molekylærbiologiske teknikker.
• Mikrobiel energetik bundet til processer som organisk stof nedbrydning og ilt-, nitrat- og sulfatrespiration.
• Biogeokemiske stofkredsløb i akvatiske miljøer. 

• Databearbejdning i grupper
• Rapportskrivning i grupper

Da det er et internationalt ph.d.-kursus, afholdes undervisningen intensivt over 3 uger i august. Rapportskrivning vil foregå i løbet af efterårssemestret.